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采血卡:收集遺傳樣品用於藥物遺傳學研究的DNA產量和質量的決定因素(2)
遺傳和藥物遺傳學研究涉及不同的中心,信使和實驗室設備。從血液樣品的高質量DNA的收集和分離是這些研究[的第一和最重要的部分。通過靜脈穿刺獲得的血液樣本(標準DNA收集方法)通tong常chang由you於yu缺que乏fa資zi源yuan或huo經jing過guo專zhuan門men訓xun練lian的de人ren員yuan或huo文wen化hua因yin素su而er無wu法fa使shi用yong。對dui於yu大da規gui模mo研yan究jiu,這zhe種zhong方fang法fa也ye可ke能neng太tai昂ang貴gui。此ci外wai,它ta是shi費fei力li和he侵qin入ru性xing的de,並bing且qie與yu潛qian在zai的de安an全quan問wen題ti相xiang關guan聯lian。樣yang品pin必bi須xu快kuai速su冷leng凍dong,液ye體ti或huo冷leng凍dong樣yang品pin的de管guan理li通tong常chang會hui導dao致zhi高gao成cheng本ben。
替代方法基於使用易於收集,運輸和儲存的DNA卡的方法是侵入性較小,並且比通常的靜脈穿刺技術[便宜得多。這些方法使用化學處理的紙卡,(現在銷售作為FTA洗脫?,Whatman公司,米德爾塞克斯,英國)或FTA標準卡?(Whatman公司)。可以從這些樣品中提取高質量的基因組DNA,在DNA庫中提供合適的檔案培養基用於法醫[或遺傳流行病學研究。
該DNA采血卡方法已經在若幹臨床研究被用在例如瘧疾,葡萄球菌,HIV,高雪氏病和癌症。我們最近使用這種方法進行藥物遺傳學子研究。DNA卡被用來從多中心臨床試驗獲得血液樣品,其中響應於替加色羅,選擇性5-HT 4受體部分激動劑,是評估腸易激綜合症患者。
本研究的目的是評估和比較來自兩種不同的DNA采血卡(IsoCode卡獲得的量和DNA的質量?或FTA經典卡?)和評價的時間和儲存溫度的影響,以及存在抗凝血劑,DNA收集。為了確保收集和分離方案的質量,通過藥物遺傳學研究中常用的幾種方法對樣品進行基因分型:多重PCR,PCR-限製性片段長度多態性(RFLP),單核苷酸引物延伸和等位基因鑒別分析。此外,它們通過全基因組擴增(WGA)擴增以增加基因組DNA質量。
